Phân loại dưới loài của Trăn đất đang gặp nhiều tranh cãi, trong đó phân loài Python molurus bivittatus đã được đề xuất phân loại thành một loài với danh pháp Python bivittatus.[7] Tuy nhiên điều này vẫn chưa còn chờ các phân tích di truyền. Một số phân loài được định danh trong loài:

• Python molurus molurus (Trăn đá Ấn Độ)
• Python molurus bivittatus (Trăn đá Miến Điện)
• Python molurus pimbura (Trăn đá Sri Lanka)

Có nguồn tin cho rằng cả ba loài này đều thuộc một chủng loài chung, trong đó Trăn đá Miến Điện và Ấn Độ được coi là hai phân loài của trăn đá châu Á (Python molurus). Còn trăn đá Sri Lanka thì rơi vào tình trạng trở thành một đơn vị phân loại bán hợp lệ, đôi khi được coi là một phân loài thứ ba, đôi khi được xem như là cùng loài với trăn đá Ấn Độ.[8]